妙蔵寺（みょうぞうじ）とは、仏教寺院の名称である。同名の寺院は、日本各地に存在する。
東北 妙蔵寺 (桑折町) - 福島県伊達郡桑折町にある日蓮本宗の寺院。山号は金理山。
関東 妙蔵寺 (茂原市) - 千葉県茂原市にある日蓮宗の寺院。山号は長谷山。 妙蔵寺 (市原市) - 千葉県市原市にある日蓮宗の寺院。山号は法輪山。 妙蔵寺 (勝浦市) - 千葉県勝浦市中谷にある日蓮宗の寺院。 妙蔵寺 (多古町) - 千葉県香取郡多古町川島にある日蓮宗の寺院。 妙蔵寺 (川口市) - 埼玉県川口市にある日蓮宗の寺院。山号は岸栄山。 妙蔵寺 (横須賀市) - 神奈川県横須賀市にある単立（日蓮宗系）の寺院。山号は大塚山。 妙蔵寺 (伊勢原市) - 神奈川県伊勢原市にある日蓮宗の寺院。山号は宝上山。
中部 妙蔵寺 (函南町) - 静岡県田方郡函南町にある日蓮宗の寺院。山号は法敬山。 妙蔵寺 (土肥町) - 静岡県田方郡土肥町八木沢にある日蓮宗の寺院。 妙蔵寺 (伊豆市) - 静岡県伊豆市にある日蓮宗の寺院。山号は超八山。 妙蔵寺 (小牧市) - 愛知県小牧市にある日蓮宗の寺院。山号は具徳山。
中国 妙蔵寺 (福山市) - 広島県福山市にある日蓮宗の寺院。山号は顕本山。 妙蔵寺 (出雲市) - 島根県出雲市にある日蓮宗の寺院。山号は法鷲山。 妙蔵寺 (平田市) - 島根県平田市多久谷町にある日蓮宗の寺院。
九州 妙蔵寺 (小城市) - 佐賀県小城市小城町布施にあるにある日蓮宗の寺院。山号は長晴山。