ハプログループE (Y染色体)（ハプログループE (Yせんしょくたい)とは、分子人類学で用いられる、人類のY染色体ハプログループの分類のうち、ハプログループDE (Y染色体)のサブクレード（細分岐）の一つで、「L339, L614, M40/SRY4064/SRY8299, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162, P168, P169, P170, P171, P172, P173, P174, P175, P176」の変異で定義づけられる系統である。約7.3万年前に東アフリカまたは西アジアで誕生した。
下位系統 E E* E1 P147/PF1938 E1* E1a M132 西アフリカの一部民族で高頻度。 E1b P177/PF1939 E1b* E1b1 DYS391p, P2/PF1940/PN2, P178, P179, P180/PF1941, P181 E1b1* E1b1a L222.1/S350.1, TSC0077541/V38, V100 アフリカ中南部。ニジェール・コンゴ語族に関連。 E1b1b M215/Page40/PF1942 アフリカ北東部。アフロ・アジア語族に関連。 E1b2 P75 E2 M75 東アフリカにみられる。
（系統はHaplogroup Tree 2015 Version: 10.26 Date: 10 April 2015による。）
E1b1a系統
ニジェール・コンゴ系民族に高頻度のタイプであり、ニジェール・コンゴ系民族の約68%に観察されるWood, Elizabeth T et al 2005 Contrasting patterns of Y chromosome and mtDNA variation in Africa: evidence for sex-biased demographic processes; also Appendix A。
英語版リンク:en:Haplogroup E-V38
E1b1b系統
アフロ・アジア系民族に高頻度に見られるタイプであり、特にベルベル人に80-93%Cruciani, F; La Fratta, R; Santolamazza, P; Sellitto, D; Pascone, R; Moral, P; Watson, E; Guida, V et al. (2004). "Phylogeographic analysis of haplogroup E3b (E-M215) y chromosomes reveals multiple migratory events within and out of Africa". American Journal of Human Genetics 74 (5): 1014–22. doi:10.1086/386294. PMC 1181964. .と高頻度である。ナイル・サハラ系民族の一部でも高頻度に見られる。下位系統E1b1b1a1b1-V13がアルバニアで高頻度でありPericic M, Lauc LB, Klarić IM, Rootsi S, Janićijevic B, Rudan I, Terzić R, Colak I, Kvesić A, Popović D, Sijacki A, Behluli I, Dordevic D, Efremovska L, Bajec DD, Stefanović BD, Villems R, Rudan P (2005). "High-Resolution Phylogenetic Analysis of Southeastern Europe Traces Major Episodes of Paternal Gene Flow Among Slavic Populations". Molecular Biology and Evolution 22 (10): 1964–75. doi:10.1093/molbev/msi185. .、有史以前のある時期にエジプト付近からの直接渡来が生じたようである。ヨーロッパで見られるタイプはほとんどがこのE-V13系統またはE-M123系統である。また話者の多くがR1bとなっているチャド語派の元来の担い手はカメルーン北部にのみ低頻度に見られるE-V259と考えられる。
英語版リンク:en:Haplogroup E-M215 (Y-DNA)
E1b1b M215/Page40/PF1942 E1b1b* - E1b1b1 M35.1 E1b1b1* - アフリカの角 E1b1b1a V68 E1b1b1a* - サルデーニャ島、モロッコ E1b1b1a1 L18, M78/PF2186 北アフリカ、アフリカの角、西アジア、ヨーロッパ E1b1b1a1a V1477 チュニジア・ユダヤ人 E1b1b1a1b V1083 E1b1b1a1b* エリトリア、サルデーニャ島 E1b1b1a1b1 V13 ヨーロッパ（特にアルバニア）カルディウム土器 E1b1b1a1b2 V22 エジプト、スーダン E1b1b1a1c V1129 E1b1b1a1c1 V12 E1b1b1a1c1* エジプト エジプト語派 E1b1b1a1c2 V264 E1b1b1a1c2a V259 カメルーン北部 チャド語派 E1b1b1b CTS1243/Z827 セム・ベルベル語派 E1b1b1b* - E1b1b1b1 L19/PF2345/V257, L335/PF2300, M310/PF2402 ベルベル語派 E1b1b1b1* - ベルベル人 E1b1b1b1a M81/PF2554 ベルベル人 E1b1b1b2 PF1961/Z830 E1b1b1b2* - E1b1b1b2a M123/PF2023 E1b1b1b2a* - 中東、北アフリカ、ヨーロッパ E1b1b1b2a1 M34/PF2022 セム語話者に広く E1b1b1b2b M293 E1b1b1b2b* - 南アフリカ、東アフリカ E1b1b1b2b1 P72 南アフリカ E1b1b1b2c V42 ユダヤ人、アラブ人 E1b1b1c V6 エチオピア E1b1b1d V92 エチオピア E1b1b2 M281, V16 エチオピア
（系統はHaplogroup Tree 2015 Version: 10.26 Date: 10 April 2015、E-M78以下は Trombetta et al.2015Trombetta et al. 2015, Phylogeographic refinement and large scale genotyping of human Y chromosome haplogroup E provide new insights into the dispersal of early pastoralists in the African continentによる。）
脚注