鳥類は、ある羽毛で覆われた獣脚類の恐竜から進化し、鳥類と恐竜を分ける線は実際にはない。しかし、K-Pg境界を境に、鳥類は生き延びたが、非鳥類型恐竜は絶滅に至った。この記事では、「鳥類（Bird）」はいわゆる鳥類綱（Aves）のクレードのメンバーとしたSereno (2005)。恐竜の中には、鳥類であるかどうか言えない種もあるが、それらは、「Proto-bird」に入れた。
当記事では、化石となった完全標本のみしか知られていない先史時代の鳥のタクサの一覧を記載した。それらの絶滅は第四紀後半以前より発生し、人類の活動によるものはなかった。人類は、鳥類とりわけそのタマゴを食用としていたが、後期旧石器時代まで鳥の個体数に深刻な影響を与えるほどの人口や技術はなかった。むしろ、ここで一覧にあげた鳥類の種は、彗星の大爆発、軌道シフト、大規模な噴火などによる気候変動のような生物以外の原因により絶滅したものである。つまり、それは、先祖あるいはより優れたタクサにより進化による置き換えにより絶滅に至ったものである。非常に多くの種の海鳥が第四紀にかけて絶滅したのは有名である。これはおそらく、少なくとも当時代に海に生きる哺乳類が出現によるものであろう。それらのタクサの関連は、しばしば、断定するのは困難である。というのも、多くは、大変部分的な遺構からしか知られておらず、DNA、RNA、たんぱく質配列からの情報分析を除き、完全な化石によってしか知られていない。
19世紀後半以前、鉱物はまだ、生物学の界のひとつとして考えられ、化石はしばしば、並行分類学として扱われていた。化石を動物あるいは植物に割りあてるよりむしろ、それらは、鉱物種として扱われ、Osteornis（骨の鳥類）あるいはOrnitholithus（鳥類の化石）を学名に使用された。後者の学名は、卵化石に割り当てる属名（oogenus）に使用されている。
先史時代の化石鳥類の分類学による一覧 系統学の分類において、目以上のタクサが与えられているかどうか疑わしい。属より下位グループにおいて、年代順で並べている。
新鳥類以外の上位グループは、Luis ChiappeChiappe (2001, 2002)により提案された系統発生に基づいて配置され、最近の研究結果も、この一覧表を改訂あるいは追記することにより反映しているSee e.g. Mortimer (2004), Sereno (2005)。
鳥群 (絶滅種) 最も原始的な鳥類は、通常、一般に脊椎は融合しておらず、長い骨尾を持つ。これらの原始的な鳥のすべてが鳥の祖先の系統にあるかもしれないとは限らない。それらが、鳥群より他の獣脚竜類に近縁ではないことは、検証されている（Xiaotingiaを参照）。
† † † (白亜紀後期) †シソチョウ目 † † [ ] † (ジュラ紀後期) † † [ ; ; ] (Late Jurassic) †ジェホロルミス目 † † † † [ ] (白亜紀前期)
尾端骨類 (絶滅) 現生の尾端骨をもつ最古の鳥類であり、尾椎骨が減少し融合している。おそらく側系統群とされる。尾端骨の二つのタイプが知られており、ひとつは、Confuciusornithidae、エナンティオルニス類などやノミンギアようないくつかの非鳥類獣脚類に、見られる棒のような形状であり、もうひとつは、現生鳥類につながる系統でのみ知られているすきの刃のような形状である。鳥類で見られる尾端骨が、実際に子孫で共通の表現形態である共有形質であることは確実とは言えないClarke et al. (2006)。
†コオウシチョウ目 † † † † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † † [ Hou et al. 2002] (白亜紀前期) † [Sapeornithiformes ] † [Sapeornithidae ] † (白亜紀前期) † [ ; ; ] (白亜紀前期)
エナンティオルニス類 (絶滅)
ここで提示したエナンティオルニス類の分類リストは2011年にトーマス・R・ホルツ・ジュニアによって公開された概要による。 Basal and Enantiornithes incerta sedis † (白亜紀後期)Kurochkin, E.N. et al. (2006) † (白亜紀前期) † † (白亜紀後期) † † [Holbotia ponomarenkoi ] † [ ] † [ootaxa] † (白亜紀前期) † † † [ootaxa] † (白亜紀前期) † † † (白亜紀後期) † † † (白亜紀前期) † † † Basal † (白亜紀後期) † † (白亜紀後期) † (白亜紀前期) † [Eocathayornis walkeri ] (白亜紀前期) † (白亜紀後期) † † (白亜紀後期) † (白亜紀前期) † (白亜紀後期) † [ ] (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † Chiappe 1993 (白亜紀後期) † † † (白亜紀前期) † † † † [Jibeinia luanhera ] (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † † † † (白亜紀前期) † † † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † † † † † [Boluochiiformes ; Longirostraviformes ] † [Boluochiidae ; Longirostravidae ] † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † [Sinornithiformes ; Euornithiformes ] † † (白亜紀前期) † † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † [Sinornithidae ] † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † [Gobipterygiformes ; Alexornithiformes ] † † (白亜紀前期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀前期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † † † (白亜紀後期) † (白亜紀前期) † † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀前期-白亜紀後期?) † † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † [ ] (白亜紀後期) † (白亜紀前期) † (白亜紀後期)
注意：この属は、として分類されることもあるが、ホルツ（2011）は、euenantiornithinesに含めていることに注意Kurochkin (2006)。ホルツは、をに入れたが、最近の研究では、Eoalulavisの近縁類として配置しているO’Connor, J.K. (2012)。
真鳥類 (絶滅) Ornithuromorphaとも呼ばれるFide Chiappe (2002)。基本的に現生鳥と同じであるが、多くはまだそのような歯や翼の爪などいくつかの原始的な特徴を持っている点が異なる。これらは、すきの刃のような形状の尾端骨と尾翼を持っている。このグループの分類は紛らわしい;「Ornithurae」の名は、1866年に、エルンスト・ヘッケルよって初めて提案された。それ以来、用語の意味について数回改訂されている。
以下は、ホルツ（2011）らによるeuornithian属のリストであるHoltz, Thomas R. Jr. (2012) Dinosaurs: The Most Complete, Up-to-Date Encyclopedia for Dinosaur Lovers of All Ages, Winter 2011 Appendix.。 † † † † [ Bell et al. 2009 (nomen nudum)] † † † † † † † () † † † † † † † † † † † ?† † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † † † [Chaoyangornithidae ] † † [Aberratiodontiformes ; Yanornithiformes ; Yixianornithiformes ] † [Aberratiodontidae ; Chaoyangornithidae ; Yanornithidae ; Yixiaornithidae ] † † (白亜紀前期) † (白亜紀前期) † [ ; ; ] (白亜紀前期)
注意：ホルツは、、、の3属をeuornitheansに含めていたが、それらは、翼竜として同定されている。
オルニトゥラエ (絶滅) † † † (白亜紀後期) † † † (白亜紀後期) † † † (白亜紀前期) † [Pteropappi ] † † [ Marsh 1873] (白亜紀後期) † [ Marsh 1880] (Cretaceous of Wallace County, US) † (白亜紀後期) † [ ; ; ; ] (白亜紀後期) (白亜紀後期)
[ Marsh 1892; (Marsh 1892) Brodkorb 1962] (白亜紀後期)
† ヘスペロルニス類
大型で、歯が存在しており、アビのように潜水する鳥類である。 † † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † † [ ] † (白亜紀後期) † † [ ; ] (白亜紀前期) † † (白亜紀後期) † † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † [ ; ; ] (白亜紀後期)
現生鳥類 基底（Basal）と未解決の形態（unresolved forms） これらの現生鳥類は、現生群のどれか一群に関連して配置することができない化石であると知られ、固有派生形質的にそれらを分類学上の目に割り当てることができない。特に白亜紀後期から古第三紀前期の分類群は、おそらくいくつかの現生の目に分かれ、古第三紀後期の分類群は、現生する科を除いて絶滅した系統が多く存在している。 † (暁新世前期から後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) †"Presbyornithidae" gen. et sp. indet. (白亜紀後期) † (白亜紀後期) † (白亜紀後期) Neornithes incerta sedis (白亜紀後期) Neornithes incerta sedis AMNH FR 25272 (白亜紀後期) Neornithes incerta sedis PVPH 237 (白亜紀後期) Neornithes incerta sedis UCMP 117598 (白亜紀後期） Neornithes incerta sedis UCMP 117599 (白亜紀後期) †"Lonchodytes" pterygius (白亜紀後期 - 暁新世前期?) † (白亜紀後期/暁新世前期) †Palaeotringa vetus † (暁新世前期) † (暁新世後期) † (暁新世) † (暁新世) †"" russelli (暁新世) † (暁新世) Neornithes incerta sedis (暁新世後期/始新世前期) † (始新世前期) † † † † (始新世前期) † (始新世前期) † (始新世前期) † (始新世前期) † (始新世前期) † (始新世前期) † † † (始新世前期) † (始新世前期) † † [ ] Neornithes incerta sedis USNM 496384 (始新世前期) † ( 始新世初期 –中期) † (始新世中期) † (始新世中期) † (始新世中期) † (始新世中期) † (始新世後期) – rallid, quercymegapodid? [Includes ; ; ; ; ] † (始新世後期) † (始新世後期) †Phasianus alfhildae (始新世後期) † (始新世後期) Neornithes incerta sedis AMNH FR 2941 (始新世後期) † (始新世後期) †Falco falconellus (or falconella; 始新世) † (始新世後期– 漸新世後期) † † † [ ] † (始新世後期–中新世初期?) † † † † † † † (始新世) † (漸新世前期) † (漸新世前期) † (漸新世前期) – falconiform (accipitrid)? A † (漸新世前期) Aves incertae sedis; A † [ ; ; ; ; ; ] (漸新世前期) † (漸新世前期) † (漸新世前期) † (漸新世前期) – pelagornithid? procellariiform (diomedeid)? † (漸新世前期) – gruiform (rallid)? † [ ; ] (漸新世前期) † (漸新世前期) †"Pararallus" hassenkampi (漸新世前期) † (漸新世前期) † (漸新世前期) † [ Aymard 1856 ; ] (漸新世前期 of France) † (漸新世前期) † (漸新世前期 – 中新世) Neornithes incerta sedis BMNH PAL 4989 (漸新世前期) †Anas creccoides (漸新世初期 - 中期) †"Charadrius" sheppardianus (漸新世中期) † (漸新世中期) †"Palaeorallus" alienus (漸新世中期) †"Vanellus" selysii (漸新世中期) † (漸新世後期) † (漸新世後期) † † † † (漸新世後期) † (漸新世後期)– Neornithes incerta sedis QM F40203 (漸新世後期) † (漸新世?) †"Anas" skalicensis (中新世初期) † (中新世前期) †"Propelargus" olseni (中新世前期) Neornithes incerta sedis MNHN SA 1259-1263 (中新世前期/中期) † (中新世中期) †"Ardea" perplexa (中新世中期) †"Cygnus herrenthalsi" (中新世中期) †"Anas" risgoviensis (中新世後期) †"Ardea" aureliensis (中新世後期) † (中新世) † (中新世) † (中新世) †"Limnatornis" paludicola (中新世) †"Picus" gaudryi (中新世) †"Ardea" lignitum (鮮新世後期) † (鮮新世) †"" †"" [] – pelecaniform (pelecanid)? A † † † (始新世中期) † †Archaeotrogonidae gen. et sp. indet. (始新世前期) † † (始新世後期/漸新世前期) † † (白亜紀後期) † † † (白亜紀後期) † † [ ] † [ ] † † (漸新世前期) † † (始新世後期) † (暁新世後期) (漸新世中期)
† (始新世前期) † (始新世前期) † [ ] † † † [ ; ] †
[Laopteryx (sic) ] (白亜紀後期?) † † (白亜紀後期/暁新世前期?)
(始新世前期) (始新世中期) † † (始新世後期) † † (始新世前期) † (暁新世) † [ ] † † (始新世中期) † (漸新世前期) † † (白亜紀後期/暁新世前期) † [Primoscenidae ] † † (漸新世前期) † † † † † † † † † †"" [Dakotornithidae Erickson 1975; ; Cracraft 1972] † [ ] (白亜紀後期 – 暁新世前期?) † [ ] † [ ] † (白亜紀後期/暁新世前期) † [ ; ; ] (白亜紀後期?) † (暁新世前期) † (暁新世前期/中期) † (暁新世) †配置未確定 "Graculavidae" gen. et sp. indet.
ダチョウ目 † † (暁始新世後期) † (中新世)
† (emuwaries) (漸新世後期 – 中新世後期) 絶滅した先史時代の鳥類 (中新世中期 – 現在)
† † (鮮新世) † 絶滅した先史時代の鳥類
† † † [ ; ; ; ; ; ; ; ; ; ] † † [ ; ; ; ; ; ] † † † Reichenbach 1853 † †
† [ ; ] (始新世中期) † [ ] 絶滅した先史時代の鳥類 [ ; ; () ] (中新世初期 – 現在)
† リトルニス目 † (False tinamous) † † (始新世前期/中期) † † [ ; ; ] (暁新世 – 始新世前期)
シギダチョウ目
† Rusconi 1958 (更新世前期/中期) † Brodkorb 1961 Tinamidae gen. et sp. indet. MACN-SC Fleagle Collection (中新世初期 - 中期) 絶滅した先史時代の鳥類
ガンガモ目
基底（Basal）と未解決の形態（unresolved forms） † Clarke et al. 2005 (白亜紀後期) † Olson & Parris 1987 [ Shufeldt 1915; Mlikovsky 2002] (白亜紀後期/暁新世前期 – 始新世前期) † (Shufeldt 1915) Olson & Parris 1987 [ Shufeldt 1915] † Olson 1999 [ (Olson 1999) Mlikovsky 2002] † Lebedinský 1927 (始新世後期/漸新世前期) † Mayr & De Pietri 2013 † Lydekker 1891 (始新世前期) † Miller & Compton 1939 (中新世前期) † Meijer 2014 – screamers † de Alvarenga 1999 † Fürbringer 1888 " † Rich 1979 (漸新世後期 – 中新世前期) † Rich 1979 (Demon-Duck of Doom) (中新世中期) † (中新世後期) † Rich 1979 † Rich 1979 † (中新世後期 – 鮮新世) † Owen 1872 † Rich 1979 – magpie-geese † Worthy & Scanlon 2009 Anseranatidae gen. et sp. nov (漸新世後期) † Wetmore 1926 † (Lydekker 1891) Harrison & Walker 1976 [ Lydekker 1891; (Lydekker 1891) Bocheński 1997; ] – only BMNH PAL 30325 belongs to this bird, may belong to Presbyornis. † Wetmore 1926 [ Wetmore 1926; Hardy 1959] (暁新世– 漸新世前期) † Olson 1994 † Kuročkin & Dyke 2010 † (Hardy 1959) Ericson 2000 [ Hardy 1959] † Wetmore 1926 [ Wetmore 1926; Wetmore 1926] † Howard 1955 † Howard 1955 † Cracraft 1970 – ducks, geese and swans † Kuročkin 1985 [ Bickart 1990] † Wetmore 1938 (始新世中期) † (漸新世前期 – 中新世前期) † Lambrecht 1931 † Korochkin 1968 † Lambrecht 1931 (漸新世中期 – 中新世前期) † Kessler & Hir 2009 † (Beneden 1883) Lambrecht 1931 [ Beneden 1883; Harrison & Walker 1979b] † Livezey & Martin 1988 (漸新世後期 – 中新世前期) † (Milne-Edwards 1868) Mlíkovský 2002 [ Milne-Edwards, 1868; (Milne-Edwards 1868) Cheneval 1987] † (Lydekker 1891a) [ (Lydekker 1891a) Brodkorb 1964; Lydekker, 1891a] † (Milne-Edwards 1863) Livezey & Martin 1988 [ Milne-Edwards 1863; Milne-Edwards 1869; Milne-Edwards 1871 Nomen nudum; (Milne-Edwards 1869) Brodkorb 1964; (Milne-Edwards 1863) Cheneval 1983b] † (Milne-Edwards 1867) Livezey & Martin 1988 [ Milne-Edwards 1867; (Milne-Edwards 1867) Cheneval 1983b] † (Milne-Edwards 1867) Livezey & Martin 1988 [ Milne-Edwards 1867; (Milne-Edwards 1867) Brodkorb 1962; (Milne-Edwards 1867) Cheneval 1983b] † Worthy 2009 (漸新世後期 – 中新世前期) † Worthy 2009 (漸新世後期 – 中新世前期) † Worthy 2009 † Worthy 2009 † Worthy 2009 † Worthy et al. 2007(中新世前期/中期) † Worthy et al. 2007 (中新世前期/中期) † Worthy et al. 2007 † Worthy et al. 2007 † Worthy et al. 2008 † Worthy et al. 2007 (Enright’s ducks) (中新世前期/中期) † Worthy et al. 2007(中新世前期/中期) † Howard 1992 (中新世中期) † Yeh 1980 (中新世中期) † Miller 1944 (中新世後期) † [] † (Tugarinov 1940) [ Tugarinov 1940] † Miller 1944 † Wetmore 1930 (中新世後期) † Louchart et al. 2005 (中新世後期 – 鮮新世前期) † (鮮新世前期) † Howard 1966 (鮮新世中期) † Short 1969 (鮮新世後期) † Ross 1935 (鮮新世後期? – 更新世後期) † (Wetmore 1924) [ Wetmore 1924] (鮮新世後期 of Benson, Arizona) † Howard 1964b † Ross 1935 † Brodkorb 1961 (鮮新世) † Worthy 2008 (鮮新世) † Howard 1964 (更新世中期) † Howard 1964 † (Short 1970) Livezey 1997 [ Short 1970] † Campbell 1979 (更新世後期) † Harrison & Walker 1978 (更新世後期) † Cenizo & Agnolín 2010 † Tonni 1979 † Zelenkov 2012 † Emslie 1992 † Zelenkov & Kuročkin 2012 [ Milne-Edwards 1867; Milne-Edwards, 1868; (Milne-Edwards 1868) Brodkorb 1964; (Milne-Edwards 1868) Brodkorb 1964] (中新世中期 - 後期) † Umanskaya 1979 † Watanabe & Matsuoka 2015 † Agnolín 2006 † Stidham & Hilton 2015 † Nesov 1986 † (Gmelin 1789) Bonaparte 1838 [ Gmelin 1789] (Labrador Ducks) † Zelenkov 2011 † Zelenkov 2011 † Zelenkov 2011 † Zelenkov 2011 † (Hou 1985) Zelenkov 2012 [ Hou 1985] † (Portis 1884) Mayr & Pavia 2014 [ Portis 1884] (鮮新世前期) † (Kuročkin 1976) Zelenkov 2012 [ Kuročkin 1976; (Kuročkin 1976) Mlíkovský & Švec 1986] 配置未確定 †"" albae Jánossy 1979 (中新世後期) †"" amotape Campbell 1979 †"" eppelsheimensis Lambrecht 1933 (鮮新世前期) †"" isarensis Lambrecht 1933 (中新世後期) †"" luederitzensis (中新世前期) †"" sanctaehelenae Campbell 1979 †"" scaldii [ Beneden 1872 nomen nudum; "Anas" scaldii] (中新世後期) †"" chauvirae (中新世中期) †"" nanus De Vis 1905 (更新世) †"" alphonsi Cheneval 1984 †"" doksana Mlíkovský 2002 (中新世前期) †"cf. " (中新世中期) †Anatidae gen. et sp. indet. MNZ S42797 (中新世前期/中期) †Anatidae gen. et spp. indet. (中新世中期) †Anatidae gen. et spp. indet. (中新世後期) 絶滅した先史時代の鳥類
† (Kuročkin 1976) Mlíkovský & Švec 1986 [ Kuročkin 1976] (漸新世中期 – 現在)
† Boeuf & Mourer-Chauviré 1992
† Kessler 2009
† Zelenkov & Kuročkin 2012
† Bickart 1990 † (Lambrecht 1933) Mlíkovský 1992 [ Lambrecht 1931a nomen nudum; (Lambrecht 1933) Kretzoi 1957; (Lambrecht 1933) Mlíkovský 1992b] † (Kuročkin 1976) [ Kuročkin 1976]