東京ヤクルトスワローズ（とうきょうヤクルトスワローズ、）は、セントラル・リーグに所属する日本の球団。運営会社の株式会社ヤクルト球団（やくるときゅうだん、）は、株式会社ヤクルト本社の連結子会社、株式会社フジ・メディア・ホールディングスの関連会社。
東京都を保護地域とし、東京都新宿区にある明治神宮野球場を専用球場（本拠地）としている。また二軍（ファーム・リーグ東地区所属）の本拠地は埼玉県戸田市にあるヤクルト戸田球場を使用している。
1950年のリーグ分裂時に日本国有鉄道（国鉄）にちなんで国鉄スワローズとして発足。その後、親会社が産業経済新聞社（フジサンケイグループ）、ヤクルト本社と変遷した。一時期はアトムズの呼称を使用していたが、のちに発足当初のスワローズに戻っている。なお、本記事ではこれらの前身球団時代についても述べる。
球団の歴史 球団創立 （昭和24年）オフにリーグ拡張方針に伴うプロ球団乱立のあおりを受け、各地の国鉄鉄道管理局（当時）の野球部から選手が引き抜かれる事態が発生した。同年の秋、当時の国鉄総裁加賀山之雄が「国鉄の新事態に即応して、身近なプロ球団を結成するということは、どんなものだろうか」という発言を行った。新事態とは国鉄がこの年に公共企業体として発足したことを指す。また、未曽有の人員整理や下山・三鷹・松川といった事件（国鉄三大ミステリー事件）も相次いで起こっていた。この暗い雰囲気を払拭して職員の士気を昂め、明るい職場づくりのためにスポーツ、特に人気の高い野球に取り組もうとしたものである。加賀山が大の野球好きだったことも参入実現の一要因となった。
交通協力会理事長の今泉秀夫（後に球団の専務取締役に就任）の草案による国鉄プロ野球団の「設置の効用」は(1)国民大衆と国鉄の結びつきを緊密、かつ和やかなものにする(2)野球を通じて国鉄職員の一本化を増進し相互の密着感を強化する(3)健全な精神、身体を持つ職員を養成する(4)国鉄部内のノンプロ野球の発展を刺激する。であった。
しかし、運輸業とその関連事業以外の副業を禁じた日本国有鉄道法に抵触するため国鉄が直接親会社になることはできず、国鉄の外郭団体である財団法人交通協力会（現：公益財団法人交通協力会・株式会社交通新聞社）が主体となり、（昭和25年）1月12日に財団法人鉄道弘済会、日本通運、日本交通公社（現：公益財団法人日本交通公社・株式会社JTB）などの企業により株式会社国鉄球団（資料によっては国鉄野球株式会社となっている物もあり） を設立。なお、交通協力会が発行する鉄道業界紙である「交通新聞」では、1950年（昭和25年）1月12日に交通協力会理事長の今泉秀夫がセントラル・リーグに加入申込みを行った「国鉄でプロ野球団結成 セントラルに参加」『交通新聞』1950年1月14日.1面 ものとされ、同じく交通協力会が発行する「交通年鑑」の「昭和25年交通年譜」では「5月18日 株式会社国鉄球団成立す」とされている。チーム名を国鉄スワローズ（こくてつスワローズ、Kokutetsu Swallows）とし（#球団名も参照のこと）、セントラル・リーグに加盟。初代監督には西垣徳雄が就任。
国鉄参入直前のセ・パはともに7球団であり、切りの良い8球団にしたいという思い、それも大企業である国鉄のプロ参入にセ・リーグ関係者は色めき立っていたが、パ・リーグとの勧誘合戦により参入が立ち消えになってしまうことを恐れ、セ・国鉄内部ともに極秘扱いで計画は進められた。参入の下準備も佳境に差し掛かる頃には巷間でも国鉄参入の噂が立っていたが、国鉄がプロ球団など作るはずがないとパ・リーグは高を括っており、参入は至って順調に成功した。本拠地は元逓信省総裁松前重義の尽力で、武蔵境の旧中島飛行機工場跡地に新しい野球場「武蔵野グリーンパーク野球場」が建設された（諸事情により1956年〈昭和31年〉閉鎖。7試合しか行われなかった）。
しかし、参入が他新球団より遅れていたため、選手確保がままならず、自前の鉄道局野球部を中心に他の社会人や大学などのノンプロ・アマチュア野球に残っている人材をかき集めたが、プロ経験者は第二次世界大戦前の一時期阪急に在籍した中村栄ただ1人という状態だった。アマチュア野球では強豪の鉄道局野球部もプロでは全く通用しなかったため、松竹ロビンスの二軍監督・森谷良平と、かつて奉天満鉄倶楽部に在籍していた宇佐美一夫を追加補強してクリーンアップに据えたものの、その後も貧打に悩まされた。
後楽園球場時代 国鉄スワローズ時代 1950年この年の記述の出典は特記ない場合、ヤクルト球団公式サイトの 球団のあゆみ 1950年代 とする 3月10日の球団初公式戦の対大洋ホエールズ戦（下関）に2対1で敗れ、続く11日の対広島カープ戦に3対2で球団初勝利を挙げる。しかし翌12日から5連敗。その間の16日の大阪タイガース戦（倉敷）では相手先発の田宮謙次郎に9回2死までパーフェクトに抑えられ、27人目の打者・中村栄の三塁内野安打で辛うじて日本初の完全試合を阻止した。その後も3月21日から14連敗、4月26日からも10連敗で最下位に沈む。あまりの弱さにセ・リーグは5月末から6月上旬まで試合日程を組まず、ミニキャンプを強制させた。その前後には打線強化のため、4月には社会人野球・コロムビアの選手兼任監督・藤田宗一を、5月には松竹ロビンスの二軍監督・森谷良平を、また6月には元・奉天満鉄倶楽部の宇佐美一夫を入団させた。
8月に享栄商の金田正一が高校を中退して入団し、10月1日にプロ初勝利を挙げるとこの年8勝を挙げ、チームは終盤13連敗の広島に代わって7位となった。
この年、チームは42勝94敗2分で首位松竹から57.5ゲーム、最下位広島と1.5ゲーム差の8球団中7位に終わる。オフに西日本パイレーツがセ・リーグを脱退したため、セ・リーグは7球団となる。
1951年 開幕から4月にかけて12勝4敗で首位に立つが、5月に入り6連敗で2位に落ちると、6月には3勝10敗として、前半戦終了時には6位となっていた。8月に入り、金田正一がこの月6勝を挙げ、チームは11勝10敗で勝ち越し5位に浮上し、そのままシーズンを終える。金田は、22勝を挙げ、最多奪三振を獲得セ・リーグで最多奪三振がタイトル制定となったのは1991年。球団公式サイトの球団のあゆみではセ・リーグ表彰で記載。 するとともに、9月5日に球団初となるノーヒットノーランを達成18歳35日での達成は日本プロ野球史上最年少記録。。土屋五郎が球団初のタイトルとなる最多盗塁を獲得。
1952年 この年よりフランチャイズ制が導入され、国鉄は読売ジャイアンツ、毎日オリオンズ、大映スターズ、東急フライヤーズと共に後楽園球場を本拠地とした。開幕から2勝2敗とした後は4連敗、4月に入り4連敗と6連敗、5月に10連敗と連敗を重ねたが、松竹と広島が低迷したことで5位でシーズンを終了。この年120試合制となり、初の50勝到達となったが、このうち半分近い24勝は金田正一で、二年連続奪三振王となった。佐藤孝夫が球団初の新人王を獲得。
1953年 松竹と大洋が合併したことで、この年からセ・リーグは現在の6球団制に移行。国鉄は45勝79敗1分に終わり、首位巨人から42ゲーム差、5位大洋松竹と4.5ゲーム差で球団史上初の最下位となる。西垣徳雄が監督を退任、後任は藤田宗一。
この年はセ・リーグが6球団制になった最初のペナントレースだったため、国鉄は「セ・リーグが6球団になった初年度のセ・リーグ最下位球団」となった。
1954年 読売ジャイアンツから移籍した宇野光雄の活躍で同年の対巨人戦8連勝。宇野と箱田弘志が球団初のベストナインを獲得する。首位中日から32ゲーム差、55勝73敗2分の5位に終わる。
1955年 10月19日、金田正一がシーズン350奪三振を記録、NPB新記録現在の記録は1968年に江夏豊が記録した401。 となると共に大リーグ・ボブ・フェラー348を抜く世界新記録。町田行彦が本塁打王を獲得。57勝71敗2分で、首位巨人と34.5ゲーム、4位広島と1ゲーム差の5位に終わり、藤田が監督退任、後任は宇野光雄。
1956年 対巨人戦で11勝（13敗）と互角の試合を見せる。大脇照夫が5月3日の対中日戦（中日）でノーヒットノーラン、宮地惟友が対広島（金沢兼六）で球団初、日本プロ野球3人目となる完全試合を達成している。チームは首位巨人と21ゲーム差、61勝65敗で4位に終わる。オフに南海ホークスから飯田徳治を金銭トレードで獲得。
1957年 金田正一は7月15日の対中日戦（中日）で2000奪三振を記録。8月21日の対中日戦（中日）でプロ野球4人目の完全試合を達成し、この年は最多勝利と最優秀防御率を獲得、沢村賞と自身初のベストナインに選ばれている。佐藤孝夫が22本塁打で本塁打王となる。チームは58勝68敗4分、首位巨人から15.5ゲーム差の4位に終わる。
1958年 開幕戦の対巨人戦（後楽園）、金田正一が巨人のルーキー長嶋茂雄を4打席連続三振に抑えるなど、4対1で勝利する。翌4月6日のダブルヘッダーでも4対2、4対3と勝利し、開幕3連勝とする。5月24日の対阪神戦（甲子園）で飯田徳治がアキレス腱切断、日本プロ野球記録の連続試合出場記録が1246で止まる。6月6日、金田が球団初の通算200勝を達成かつ、球団史上唯一。。チームは2年連続の58勝68敗4分、首位巨人から17.5ゲーム差の4位に終わる。金田正一が投手部門三冠王（最多勝、防御率、奪三振）と沢村賞を獲得。
1959年 この年も開幕戦の対巨人戦（後楽園）で金田正一が巨人のルーキー王貞治を2三振に抑えている。チームは63勝65敗2分、首位巨人から15.5ゲーム差の4位に終わる。
1960年 9月30日に金田正一が対中日戦（後楽園）で勝利して、10年連続20勝を達成するが、チームは54勝72敗4分、首位大洋から17.5ゲーム差、1953年以来7年ぶりの最下位となる。限りで宇野は監督を解任週刊ベースボール60周年記念企画【週ベ60周年記念企画142】『川上監督の考えた三つの人事～主将、あと一人のコーチ、トレード問題』【1960年12月28日号】週刊ベースボール。後任は砂押邦信。
1961年 6月6日、森滝義己がプロ野球史上5人目となる完全試合を達成。67勝60敗3分で3位とし、球団史上初、国鉄球団として唯一となったAクラス、シーズン通算勝ち越しを記録する。
1962年 9月5日、金田正一がメジャーリーグ、ウォルター・ジョンソンの記録を抜く通算3,509奪三振を達成。51勝79敗4分、首位阪神から24ゲーム差の最下位となる。セ・リーグは3割打者が1人という投高打低のシーズンだったが、その中でも国鉄のチーム打率は.201（313得点）で、これは2リーグ制以降の最低の記録である。11月、東映と共に韓国に遠征し、親善試合を行う。砂押は監督を退任、後任は浜崎真二。オフに西鉄から豊田泰光を獲得。
年々増大する経営費のために経営主体は交通協力会から鉄道弘済会へと変わっていたが、公共企業・国鉄の球団であるという体面もあり、相当の緊縮財政だった。新人選手の契約金は高騰する一方で満足な補強もできず（当てになる戦力は金田だけだった）、同年に起こった三河島事故による批判は球団にも飛び火していた。この年の8月、球団譲渡を前提とした業務提携を産経新聞社、フジテレビジョン・ニッポン放送・文化放送と結び、フジサンケイグループとの関係が生じ、この時点で実質的な経営主体はフジサンケイグループに移る。
国鉄は1965年5月10日に球団名をサンケイスワローズに変更することから、国鉄スワローズとしての最下位はこの年で最後となった。
1963年 5月8日の対大洋戦（後楽園）で金田正一が通算300勝を達成。チームは65勝73敗2分、首位巨人から18ゲーム差の4位。浜崎は監督を退任、後任は林義一。
この年を最後に国鉄は後楽園球場を東映に譲り、明治神宮球場に移転した（移転の経緯については後述のフジサンケイグループ及び明治神宮野球場#プロ野球を参照）。
明治神宮球場移転後 1964年 7月30日、金田正一が入団2年目の1951年から14年連続となるシーズン20勝を達成。61勝74敗5分、首位阪神と18.5ゲーム差の5位に終わる。オフに林義一の監督更迭・留任を巡り、産経新聞と国鉄は激しく対立。エースの金田が「林監督がそのまま続投した場合移籍するが、解任された場合は残留する」との声明を出したことから国鉄は頑として林の更迭を主張、一方の産経サイドは他社マスコミ（読売新聞、朝日新聞、毎日新聞）により、「林監督更迭」のスクープを先取りされていたことがあり、議論は平行線を辿り最終的には経営主体の産経サイドが意見を押し切った。林は留任し、金田は10年選手の特権を行使して巨人に移籍した。金田を失ったことにより国鉄は経営意欲を完全に喪失し、フジサンケイグループへ経営権を全て譲渡して経営から撤退することとした。もとより国鉄球団は業務提携後フジサンケイグループの資金力に丸々依存しており、移譲は時間の問題と見られていたが、喧嘩別れで球団譲渡という結末となった。
サンケイスワローズ時代 1965年4月23日、国鉄は球団の経営権を産経新聞とフジテレビに譲渡することを発表し、5月10日、球団名をサンケイスワローズ（Sankei Swallows）に変更。
1965年 サンケイ初年度となったが、国鉄初年度以来の90敗以上となる44勝91敗5分。首位巨人とは45.5ゲーム差となった。この年からドラフト会議が行われているが、1位指名の河本和昭を始め、11名中9名が入団拒否指名後の入団交渉不実施による失効を含む。 しているただし、この時代はサンケイに限らず、指名されても入団拒否したり、指名しても交渉を実施せずそのまま失効する者は多かった。。
サンケイは1966年から球団名をサンケイアトムズに変更することから、サンケイスワローズとしての最下位はこの年が最初で最後となった。
サンケイアトムズ時代 1966年1月7日、少年野球ファン開拓のため という理由に加え、フジテレビで鉄腕アトムが放送されていたことや手塚治虫が当時球団後援会副会長（会長は徳川夢声）だったという経緯もあって鉄腕アトムをペットマークに使い、球団名をサンケイアトムズ（Sankei Atoms）、法人名を株式会社サンケイアトムズに変更。ヤクルト本社が株式を取得して球団運営に参加。これに伴い、球団旗も当時の産経新聞の社旗をアレンジしたものを使っていた。
1966年 52勝78敗で大洋と並んで5位、首位の巨人とは37ゲーム差。
サンケイは1969年に球団名をアトムズ、1970年から球団名をヤクルトアトムズに変更することから、サンケイアトムズとしての最下位はこの年が最初で最後となった。
1967年 58勝72敗5分で首位の巨人と26ゲーム差の5位。巨人に3勝23敗の惨敗。後楽園球場で13連敗。武上四郎が新人王を獲得。
1968年 1月28日、神奈川県横須賀市に武山球場が完成、二軍本拠地となる。
5月26日には対広島戦に勝利し、球団通算1000勝を達成。来日2年目のデーブ・ロバーツが40本塁打を打つなどして、ベストナインを獲得。投手では石戸四六がチームとしては金田正一以来となるシーズン20勝を挙げる。64勝66敗4分、首位の巨人とは13ゲーム差の4位。
アトムズ時代 産経新聞は本体の業績不振のため、株式の一部をヤクルト本社へ売却。球団経営に積極的だった産経新聞・フジテレビジョン社長の水野成夫が病に倒れ、後を継いだ鹿内信隆がフジサンケイグループの事業見直しを行った結果、不採算だったプロ野球球団経営からの撤退、資本関係のみの継続を決めたもの。当時、ヤクルト本社は水野とは旧知の間柄だった南喜一が代表者を務めていた。実質の経営権はヤクルト本社が握ったが、表面上は共同経営とし、球団名をアトムズ (Atoms) 、法人名を株式会社アトムズ球団とした。これは、2リーグ分立以降で球団名に法人名・地域名などの冠名がつかない唯一の例となった。
1969年 ボブ・チャンスが24試合で12本塁打を記録し、58勝69敗3分で、首位の巨人と16.5ゲーム差の5位だった。
ヤクルトアトムズ時代 1970年1月7日にヤクルト本社が公式に単独で経営権を持ち、球団名をヤクルトアトムズ（Yakult Atoms）、法人名を株式会社ヤクルトアトムズに変更となり、チームカラーもヤクルト本社の社色である赤・白・緑のものとなった（球団旗やユニフォームなどに使用）。
別所監督時代 1970年 序盤から大きく出遅れ、8月には1936年の大東京軍と並ぶ16連敗を喫した当時の日本プロ野球ワースト記録で、現在もセ・リーグワースト記録及び、間に引き分けを挟まない連敗のワースト記録である。日本プロ野球記録はパ・リーグの千葉ロッテマリーンズがに記録した18連敗（引き分け1を挟む）。。この連敗期間中の8月20日に別所毅彦が監督を解任され、二軍監督の小川善治がシーズン終了まで監督代行を務めた。結局、シーズン92敗を喫しセ・リーグでの90敗到達球団はその後2003年まで現れなかった（横浜ベイスターズ、94敗）。、33勝しかできず、勝率は3割を大きく下回る.264日本プロ野球でシーズン最終勝率が3割を下回ったのは1961年の近鉄バファローズ以来9年ぶり。これ以後、セ・リーグで勝率が3割を下回った例はなく、パ・リーグでも東北楽天ゴールデンイーグルスが新規参入した1年目の2005年に.281を記録した1例のみ。 で、首位の巨人に45.5ゲーム差を付けられ、1966年以来4年ぶり、ヤクルト譲渡後の最下位に終わる。巨人戦、阪神戦ともに5勝21敗で後楽園球場では13戦全敗。2桁勝利投手ゼロは球団史上初。東条文博が28盗塁で盗塁王。
三原監督時代 1971年 三原脩が監督に就任。チームは52勝72敗6分けの勝率.419と前年より盛り返すものの、2年連続最下位に終わる。松岡弘は14勝を挙げた。9月27日、二軍はイースタンリーグで初優勝している。
ヤクルトは1974年から球団名をヤクルトスワローズに変更することから、ヤクルトアトムズとしての最下位はこの年で最後となった。
1972年 前年に三原とともに入団した中西太打撃コーチのマンツーマン指導を受けた2年目の若松勉が首位打者、ルーキーの安田猛も1972年・1973年と2年連続で防御率1位となって頭角を現す。彼らの活躍もあり、この年は最下位を脱出、60勝67敗3分けの勝率.472の4位に浮上。8月12日、二軍は2年連続イースタンリーグ優勝。
1973年 元々鉄腕アトムのイラストについては「限定的に使用する」ことで、手塚治虫および虫プロダクションと合意していたが、球団後援会が作成したファンサービス用グッズ（シャツ・灰皿・トランプなど）にアトムのイラストを使用したことで、前年12月に虫プロ側から「グッズを販売する業者から我々の著作権を侵害していると抗議が殺到した。商品化に結び付けるなら新たに版権の契約を結んでほしい」クレームが来た。その後版権料の問題で交渉がまとまらなかったことから、球団は手塚および虫プロに謝意を示した上で、1月からニックネームの変更の検討を開始した。
検討過程では「パンダ」「ベアーズ」「東京ヤクルト」「ファイアマン」などが挙がったが、「パンダース」は「売春宿の主人」を意味するスラングなことから、早々に候補から外れ、一旦は「ヤクルト・ジャガース」（豹）に内定し、オールスター後から使用すると発表したが日刊スポーツ、1973年5月1日付。サンケイスポーツ、1973年5月5日付。、結局シーズン中の球団名変更は見送りとなった。その後の再検討の結果、球団名は「ジャガース」を撤回し、国鉄時代の「スワローズ」を復活させることになったヤクルトと同じくセ・リーグに属する阪神タイガースの二軍が、過去に類似した名称の『阪神ジャガーズ（ジャガース）』を名乗っていたことによる、阪神球団との権利上の問題が関係しているかは不明。。
このシーズン途中から現役大リーガーのジョー・ペピトーンが入団するも、大リーグ時代からの素行の悪さが改善されることはなく、無断欠場を繰り返した挙句、来シーズン開幕前に退団した。チームは62勝65敗3分けの勝率.488にて2年連続の4位に終わり、三原は監督を辞任。
ヤクルトスワローズ時代 前述の著作権問題の経緯と虫プロダクションが1973年11月5日付での倒産不可避となったことが重なり、鉄腕アトムのキャラクター使用を中止した。1973年10月26日、球団名をヤクルトスワローズ、法人名を株式会社ヤクルト球団に変更。キャラクターもツバメをモチーフにしたものに変更。
荒川監督時代 1974年 打撃コーチの荒川博が監督に昇格、コーチで入団した広岡達朗・沼澤康一郎・小森光生と「早大カルテット」を形成した。松岡が17勝、浅野啓司も防御率2位と活躍し、チームは60勝63敗7分けの勝率.488にて13年ぶりのAクラスとなる3位。
1975年 日本ハムとの交換トレードで大杉勝男を獲得したが、結果は57勝64敗9分けの勝率.471の4位。オフに武上四郎が引退。
1976年 5月12日に監督の荒川が成績不振を理由に休養し、翌日からヘッドコーチの広岡達朗が監督代行として指揮を指揮を執ることを発表した。
広岡監督時代 ※1976年6月16日までの監督代行時代も含める。 1976年 6月17日から監督代行の広岡が正式に監督として指揮を執ることを発表した。結局、52勝68敗10分けの勝率.433の5位に終わり、国鉄時代のからこの年まで15年連続シーズン負け越しを記録し、セ・リーグワースト記録となる日本記録は南海ホークス時代の1978年から福岡ダイエーホークス時代の1993年にかけて記録した16年連続。。なお、全球団に負け越したにもかかわらず、最下位を免れたのはNPB史上初めてのケースだった。
1977年 大杉がこの年多くの記録を立て6月5日に1000打点、6月22日に1500試合出場、8月11日に350本塁打、8月25日に1500本安打。、9月14日の大洋戦では1イニング5本塁打の日本タイ記録を達成した。若松が2度目の首位打者、入団2年目のチャーリー・マニエルが42本塁打を放つ。62勝58敗10分けの勝率.517により、チームは球団創設以来初の2位に躍進。
1978年 前年の2位躍進に気をよくしたフロントは選手に対し、「ブラジルへの慰安旅行」を計画したが、監督の広岡はこれに反対し、「旅行するぐらいなら温暖な海外でキャンプを」と希望。これを受けて2月、球団史上初めて日本国外キャンプとなるアメリカ・ユマでキャンプを行う。広岡の参謀として巨人時代の同僚だった森昌彦をヘッドコーチに招聘し、キャンプでテストを受けたデーブ・ヒルトンも加わり打線は厚みを増した週刊ベースボールプラス6 1950-2011 わが愛しのスワローズ 国鉄から始まった栄光の軌跡、ベースボール・マガジン社、2011年、P39。初優勝を狙うチームは前半を首位で折り返すも、後半に入り、失速、3連覇を狙う巨人に抜かれ、8月には一時4.5ゲーム差を付けられるが、8月26日からの対巨人3連戦を松岡の完封、安田の連日の好リリーフで2勝1分けと持ち直し、巨人に代わり首位に返り咲く。9月に初めてマジックが点灯すると、9月19日のダブルヘッダー第2試合、さらに杉浦亨が連日のサヨナラ打を放った20日・21日と3試合連続サヨナラ勝ちを収め、下位球団相手に取りこぼす巨人を尻目に一気に加速、10月4日の対中日戦（神宮）で創立29年目で初のリーグ優勝を本拠地で決めた。これにより、セ・リーグ全球団がリーグ優勝を達成した。これは、セ・リーグが6球団制になった1953年から数えて25年目のことである。日本シリーズではそれまで3年連続日本一だった阪急ブレーブスを4勝3敗で下し、球団史上初の日本一を達成した。この年は開幕から129試合目まですべて得点を挙げていたが、最終戦の広島戦で大野豊に完封負けを喫し、全試合得点とはならなかった。なお、広岡監督が正力松太郎賞、若松がチーム初のセ・リーグ最優秀選手に選出された。
1979年 マニエルの近鉄への放出を軸としたオフの補強に失敗し、開幕8連敗と大きく出遅れる。5月に盛り返し、5月27日にはマニエルに代わる新外国人ジョン・スコットがサイクル本塁打を放つ活躍で勝率を5割まで戻すが、その後は再び最下位を独走。8月17日に作戦兼バッテリーコーチへの役職変更を申し渡されたヘッドコーチの森と二軍への降格を申し渡された投手コーチの植村が休養し、これに激怒した監督の広岡が辞任し、翌日から打撃コーチの佐藤孝夫が監督代行として指揮を執ることを発表した。結局、48勝69敗13分で1971年以来8年ぶり、球団名変更後初の最下位。日本一の翌年に最下位に転落するのは1961年の大洋以来18年ぶり2度目の不名誉。
武上監督時代 1980年 武上四郎が球団史上初の生え抜き監督に就任。相性優先のローテーションで巨人・中日・阪神・大洋から15勝以上挙げるが、広島東洋カープに大きく負け越し、結局この年優勝した広島に大差をつけられての68勝52敗10分けの勝率.567、2位に終わった。松岡が最優秀防御率のタイトルを獲得した。オフに福富邦夫が現役を引退した。
1981年 マニエルが近鉄から復帰し、優勝への期待が高まるが、マニエルは年齢的な衰えで12本塁打に止まり、さらに若松、スコットが相次いで負傷し、外野陣が崩壊、出場機会が大幅に増えた代走・守備固め専門の青木実が盗塁王を獲得したが、チームは56勝58敗16分け勝率.491の4位に終わる。
1982年 優勝当時の主力である大杉、大矢明彦、松岡らの衰えと外国人選手ラリー・ハーローらの不振からシーズン序盤より最下位を独走。最終結果は45勝75敗10分け、勝率.375で首位の中日と23.5ゲーム離される。
1983年 ドラフトにて巨人との抽選の末入団交渉権を獲得した荒木大輔が入団し、近鉄とのトレードで井本隆を獲得する。しかし、チームは井本や松岡、ボビー・マルカーノらの不振もあり、53勝69敗8分けの勝率.434にて2年連続最下位に終わった。オフに大杉が現役引退。
1984年 4球団競合の末ドラフト1位で獲得したルーキーの高野光が開幕投手に大抜擢され話題となったが、開幕からチームは不振が続く。4月26日に監督の武上が成績不振を理由に辞任し、28日から西鉄・日本ハムでの監督を経験したヘッド兼打撃コーチの中西太が監督代行を務めた。結局、5月24日に監督代行の中西が成績不振を理由に辞任し、25日から日拓ホームでの監督を経験した投手コーチの土橋正幸が代理監督代行として指揮を執ることを発表した。
土橋代理監督時代 ※1984年6月14日までの代理監督代行時代も含める。 1984年 6月15日から代理監督代行の土橋が正式に監督として指揮を執ることを発表した。51勝71敗8分けの勝率.418の5位となり、辛くも最下位を免れた。
1985年 明治大学の主砲広沢克己（後に広澤克実）を獲得。八重樫幸雄が捕手として球団初の3割打者、杉浦享も自己最多の34本塁打と活躍したが、チームはシーズン早々から首位戦線から1チームだけ脱落し、神宮で阪神に優勝を決められ、結局46勝74敗10分け勝率.383の最下位。10月9日に若松が2000本安打を達成。オフに優勝バッテリーの松岡と大矢が共に現役を引退した。同年、日本プロ野球選手会は労働組合の資格を得たが、オーナーの松園尚巳は「（親会社の）ヤクルト本社をはじめ、グループ内で労組を結成している会社は無い」として、ヤクルト選手会を労組選手会から脱退させた。
1986年 マルカーノに代わり、大洋を自由契約になったレオン・リーが入団するが、この年もシーズン早々から首位戦線を脱落。10月にマーク・ブロハードの本塁打で巨人優勝の望みを打ち砕くも、2年連続で今度は広島に神宮で優勝を決められ、49勝77敗4分けの勝率.389と2年連続最下位となり、土橋は辞任。
ヤクルトは2006年から球団名を東京ヤクルトスワローズに変更することから、ヤクルトスワローズとしての最下位はこの年で最後となり、翌年から2006年にかけて20年間、最下位を回避することになる。
関根監督時代