SARS-CoV-2 Gamma-varianten, også kalt Lineage B.1.1.248, også kalt Brazil(ian) coronavirus variant,Covid-19: Brazil virus already in UK ‘not variant of concern’, scientist says 15. januar 2021 www.bbc.com lest 15. januar 2021COVID-19: Virologist says Brazilian coronavirus variant detected in UK is not the one 'of concern' 15. januar 2021 news.sky.com lest 15. januar 2021 er en variant av SARS-CoV-2-viruset som forårsaker covid-19.Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn 12. januar 2021 www.telegraph.co.uk, lest 17. januar 2021
Navn Den 1. juni 2021 navngav Verdens helseorganisasjon (WHO) B.1.1.248 som Gamma-varianten.
Bakgrunn, beskrivelse Denne varianten av SARS-CoV-2 ble først oppdaget av Det nasjonale institutt for smittsomme sykdommer (NIID) i Japan den 6. januar 2021 i fire personer som var ankommet Tokyo etter å ha besøkt Amazonas i Brasil fire dager tidligere. Den brasilianske statsstyrte Oswaldo Cruz-stiftelsen har bekreftet at man tror varianten har versert i den brasilianske regnskogen, siden juli 2020.How worrying are the UK, South Africa, and Brazil Covid variants? Michelle Roberts www.bbc.co.uk, lest 15. januar 2021
Et preprint av en forskningsartikkel av Carolina M. Voloch et al. beskrev slektskap mellom brasilianske sekvenseringer i 2020 og identifiserte en ny linje SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', i omløp i Brasil, som var utgått fra B.1.1.28. Den beskrives som fremstått i juli og først oppdaget av dem i oktober, men på publiseringstidspunktet (desember 2020), var det - skjønt etterhvert mye mer frekvent enn før - foreløpig mest å finne i Rio de Janeiro.Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil (Abstract) Carolina M Voloch et al. via www.medrxiv.org, lestd 15. januar 2021 doi.org/10.1101/2020.12.23.20248598 I mai hadde deres funn for det meste vært av B.1.1.33 men i september var det betydelig spredning av B.1.1.28, og i oktober og november dominerte den nye variantlinjen (B.1.1.248) tre til fire ganger over andre klassifiseringer ved bruk av pangolinverktøy.Voloch, Carolina M.; et al. (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil" full text (see figure 5). Lest 15. januar 2021. – via Medarxiv. Artikkelen identifiserer mutasjonen E484K (til stede i både B.1.1.28 og B.1.1.248) som «viden spredt» blant prøvene (for eksempel, 36 av de 38 prøvene i ett sett).
Mutasjoner Denne varianten av SARS-CoV-2 har 12 mutasjoner i sitt piggprotein, blant annet N501Y og E484K.
Deteksjon Isolat av den nye varianten overført til GISAID og gitt ID-spennet EPI_ISL_792680 til EPI_ISL_792683.
Statistikk + Kasus etter land (Per 18. januar 2021) Land Bekreftede tilfeller Dato Referanser Japan 4 6. januar 2021 Brasil 13 14. januar 2021 Verden (to land) 17
Referanser
S03